仏教の葬儀において、特に浄土宗系(本願寺も含みます)や日蓮宗・日蓮正宗では必ず必要とされます。 私自身は日蓮正宗の経験が一度しか無いのですが、かなり「御本尊」を大切に取り扱っておられた印象です。
他の宗派に関しては、祭壇などの変化(生花を使った祭壇など)もあって、必ずしも必要とは言われないです。
しかし仏壇などの場合は、本尊を飾ることがほとんどだと思います。